Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3b4Q8QZY9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sf3b4Q8QZY9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms