Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxn4Q8K3Q3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxn4Q8K3Q3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms