Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rdh16f2Q8K3M1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms