Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cdk5rap2Q8K389 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdk5rap2Q8K389 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cdk5rap2Q8K389 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms