Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms