Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccm2Q8K2Y9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccm2Q8K2Y9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms