Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brd3Q8K2F0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd3Q8K2F0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms