Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1T0

Tmprss3, Transmembrane protease serine 3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss3Q8K1T0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmprss3Q8K1T0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmprss3Q8K1T0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms