Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spire2Q8K1S6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spire2Q8K1S6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms