Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmbrd1Q8K0B2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms