Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms