Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup88Q8CEC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup88Q8CEC0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms