Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lrrc9Q8CDN9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lrrc9Q8CDN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrrc9Q8CDN9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms