Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI6

Ccdc158, Coiled-coil domain-containing protein 158, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc158Q8CDI6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc158Q8CDI6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc158Q8CDI6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc158Q8CDI6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms