Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf20l1Q8CCJ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf20l1Q8CCJ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms