Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RybpQ8CCI5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RybpQ8CCI5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RybpQ8CCI5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms