Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB67

Lrp11, Low-density lipoprotein receptor-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp11Q8CB67 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrp11Q8CB67 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrp11Q8CB67 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms