Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Spef2Q8C9J3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Spef2Q8C9J3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms