Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp20Q8C6M1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp20Q8C6M1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp20Q8C6M1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp20Q8C6M1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp20Q8C6M1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp20Q8C6M1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms