Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4930504O13RikQ8C5Z9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930504O13RikQ8C5Z9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930504O13RikQ8C5Z9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms