Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gpcpd1Q8C0L9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpcpd1Q8C0L9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpcpd1Q8C0L9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms