Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx16Q8C080 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx16Q8C080 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx16Q8C080 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx16Q8C080 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snx16Q8C080 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Snx16Q8C080 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Snx16Q8C080 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Snx16Q8C080 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Snx16Q8C080 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Snx16Q8C080 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Snx16Q8C080 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx16Q8C080 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx16Q8C080 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms