Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trerf1Q8BXJ2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Trerf1Q8BXJ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trerf1Q8BXJ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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