Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sall4Q8BX22 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sall4Q8BX22 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms