Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Triml1Q8BVP1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Triml1Q8BVP1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Triml1Q8BVP1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms