Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmod1Q8BVA4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmod1Q8BVA4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmod1Q8BVA4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms