Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp54Q8BL06 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp54Q8BL06 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp54Q8BL06 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms