Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zcchc4Q8BKW4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zcchc4Q8BKW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms