Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmem87bQ8BKU8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem87bQ8BKU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem87bQ8BKU8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms