Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan12Q8BKT6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tspan12Q8BKT6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms