Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdca8Q8BHX3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdca8Q8BHX3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms