Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Susd4Q8BH32 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Susd4Q8BH32 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms