Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bhlhe23Q8BGW3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms