Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms