Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vipas39Q8BGQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms