Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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