Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc172Q810N9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc172Q810N9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms