Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prima1Q810F0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms