Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5bQ80Y84 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5bQ80Y84 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5bQ80Y84 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5bQ80Y84 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5bQ80Y84 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5bQ80Y84 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Kdm5bQ80Y84 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms