Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClmQ7TSN2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms