Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp6r1Q7TSI3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp6r1Q7TSI3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms