Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PhkbQ7TSH2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PhkbQ7TSH2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PhkbQ7TSH2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms