Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vma21Q78T54 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms