Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim12Q78RX3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim12Q78RX3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms