Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmed3Q78IS1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed3Q78IS1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms