Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nme8Q715T0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nme8Q715T0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms