Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd3Q6ZQK0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd3Q6ZQK0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ncapd3Q6ZQK0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms