Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ino80Q6ZPV2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ino80Q6ZPV2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ino80Q6ZPV2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms