Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cxcl3Q6W5C0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms