Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rhox8Q6VSS7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rhox8Q6VSS7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rhox8Q6VSS7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms